质谱法是将样品离子化，变为气态离子混合物，并按质荷比（m/z）分离的分析技术。
质谱法最简单的用途为分子量测定（点击进入）。
根据特征碎片离子也可以用来对分析物进行定性分析。
此外，根据质谱峰强来可以进行分析物的定量分析。
质谱仪由以下几部分组成
数据及供电系统
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进样系统 离子源 质量分析器 检测接收器
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离子源: 使被分析样品的原子或分子离化为带电粒子(离子)的装置,并对离子进行加速使其进入分析器，根据离子化方式的不同,生物大分子的分析常用的有:
1,ESI(Electrospray Ionization):电喷雾电离——属最软的电离方式
2,MALDI(Matrix Assisted Laser Desorption):基质辅助激光解吸电离
按质量分析器,常见下列几种:
四极杆质谱仪(Q).
离子阱质谱仪（Ions TRAP）.
飞行时间质谱仪(TOF).
傅里叶变换-离子回旋共振质谱仪(FT-ICRMS).
分子量是蛋白质关键特征参数之一，也是有机化合物最基本的理化性质参数。
分子量正确与否往往代表着所测定的有机化合物及生物大分子的结构正确与否。
分子量同时也是多肽、蛋白质等鉴定中首要参数，随着基因组和蛋白质组研究的推进，蛋白质分子量测定的科学研究工作已经受到越来越广泛的关注。
以下方法通过 ESI-TOF精确测定蛋白分子量 ，所用仪器Mass Spectrometer TripleTOF 5600 Manufacturer AB Sciex Instruments，与此还与其他分子量质谱检测方法联用，结果得到进一步确证。
质谱分析（Mass Spectrometry,MS）是将化合物形成离子和碎片离子，按照质荷比（m/s）不同进行分离从而进行成分和结构分析的技术，所得结果将用质谱图（Mass spectrum）展示。
我们再根据质谱图提供的信息进行生物大分子的结构分析、有机物和无机物的定性以及定量分析。
生物质谱（Bio-mass Spectrometry,Bio-MS）是用于分析生物大分子的质谱蛋白质测序技术。
众所周知，生物大分子多数以高分子质量区别于无机、有机小分子。
对后者而言，质谱检测只要求测定几十到2000不等的相对分子量，而生物质谱技术要求上万甚至是几十万的相对分子量，因此适合无机、有机小分子分析的质谱检测技术不能应用于生物大分子的分析。
随着ESI和基质辅助激光解吸电离（MALDI）技术的完善和成熟，生物大分子的质谱检测分析才得以实现。
液相色谱-质谱联用技术（LC-MS）是以质谱仪为检测手段，集HPLC高分离能力与MS高灵敏度和高选择性于一体的分离分析方法。
尤其是近年来，随着电喷雾、大气压化学电离等软电离技术的成熟，使得样品蛋白质测序的定性定量分析结果更加可靠，同时，由于液相色谱-质谱联用技术对高沸点、难挥发和热不稳定化合物的分离和鉴定具有独特的优势，
因此，它已成为中药制剂分析、药代动力学、食品安全检测和临床医药学研究等不可缺少的手段。